Yaiba va aprendiendo nuevas técnicas y recordando experiencias pasadas para demostrar que es el verdadero samurái legendario.

Para ello se enfrenta a viejos enemigos, a nuevos, descubre documentos secretos y, sobre todo, debido a la necesidad urgente de evitar que Onimaru destruya las espadas que sirven de sello para mantener dormido al monstruo más terrible de la historia japonesa, arriesga algo más que su vida.

Para ayudarle en tan noble causa, Sayaka se sacrifica, su espada invencible también, pero el monstruo torna a la vida, más poderoso que nunca, y Yaiba...